由于胃肠感冒主要是由柯萨奇病毒感染所造成的，因此主要是以对症支持治疗为主。
体温过高时，可以口服止痛口服液；腹痛症状明显时，可以考虑口服山莨菪碱或颠茄合剂；腹泻症状明显时，可以考虑口服蒙脱石散或盐酸洛哌丁胺；另外还可以考虑口服补液盐来纠正和预防脱水以及电解质紊乱。如果明确合并细菌感染时，还可以选用左氧氟沙星和诺氟沙星口服。
建议去正规的医院专科检查，在明确病因的情况下接受治疗，不要盲目的在外面买药使用，以免带来不必要的麻烦。