甲减可能会引发甲减性心肌病变。
到甲减症状持续恶化时所引起的并发症主要有皮肤干燥，皮肤发黄，行动迟缓，疲劳，怕冷，体质虚弱，记忆力减退，注意力不集中，便秘，指甲易碎，月经不规律，甲状腺肿大等等。男性还有可能会出现性功能下降，副性征落后，阳痿，性欲减退，性成熟推迟等等。
甲减还会对肠胃造成一系列疾病，使患者出现便秘，腹胀，食欲减退等现象，严重者还可能会引发麻痹性肠梗阻。部分患者会出现完全性胃酸缺乏。