扁平疣二氧化碳激光一般不会留疤。
目前在临床上激光的应用比较广泛，扁平疣也可以选择激光治疗，但是治疗之后可能会留疤，对于这种轻微的疤痕可以在局部擦涂祛疤药物进行改善。但是一般情况下基本不会留疤，只有在伤口出现了感染时，可能会留下疤痕。
建议：做完二氧化碳激光之后要注意避免治疗部位过度清洗，出门时要注意防晒有利于治疗部位的恢复。