肾病综合征常见原发性肾小球疾病治疗目的为抑制炎症及免疫反应，所用药物主要为糖皮质激素与免疫制剂，据不同病理类型采用针对性的治疗。
长期使用激素与免疫制剂将导致机体防御疾病能力减弱，不利于治疗，故治疗过程中需配合非药物治疗如保持良好情绪、适当运动。肾病综合征治疗过程中需定期复查如定期监测尿蛋白、尿微量白蛋白、24小时尿蛋白定量、血常规、肝功能、肾功能等。原发性肾病综合征，首选糖皮质激素；对激素不敏感或者依赖者，采用细胞毒类药物，比如环孢素、骁悉；继发性肾病综合征，比如肝炎相关，抗病毒治疗；肾病综合征合并血栓、栓塞，抗凝、抗血小板聚集、溶栓治疗；合并高血脂，降脂治疗；合并感染，抗感染治疗；合并肾衰竭，透析治疗。
建议卧床休息，给予低盐、利尿消肿等治疗。肾病综合征由于细胞或体液免疫导致的免疫炎症性疾病，故常用免疫抑制剂治疗。糖皮质激素也用于肾脏疾病，普通剂量主要是针对抗炎作用。