儿童尿路感染治疗具体需要根据儿童尿路感染的复杂性和病因进行选择，一般为药物治疗。
除单纯性尿路感染之外，要注意是否有泌尿生殖器畸形，比如巨输尿管症、异位输尿管开口、尿道瓣膜症、肾盂输尿管连接部梗阻等，需要进一步明确病因。如果是解剖畸形引起的感染，需要根据病情解除畸形，才能很好的控制感染。如果是单纯性的尿路感染，没有泌尿生殖道畸形的患者，通常规范治疗即可。由于儿童处于生长发育期，有的药物会影响骨发育，因此在应用抗生素的时候，需要做相应的选择。对于儿童，一般应用青霉素类、头孢类或者大环内酯类抗生素。
建议在进行药物治疗的同时，要多给孩子喝水，适当的让孩子进行活动，促进泌尿道排尿。在治疗期间和治疗后也要多注意清洗阴部，多换洗内衣内裤。