化脓性中耳炎的治疗要根据化脓严重程度来选择药物治疗、手术治疗。
药物治疗：化脓较轻则可以用消毒后的棉签清理脓液，清洗外耳道，将脓液清理干净后再局部涂抹消炎药物。手术治疗：化脓性非常严重，头部疼痛难忍、听力严重下降，则可以采取手术治疗，进行鼓膜穿刺，抽取中耳腔中的积液或脓液，再在鼓室腔注射消炎药物来进行处理。
化脓性中耳炎的脓液清理很关键，如果耳道不能保持干燥清洁，容易造成再次感染。