扁桃体发炎化脓的原因主要有两点：机体的防御能力降低或者细菌和病毒的感染
，第一，机体的防御能力降低，比如当情绪波动，劳累过度，睡眠不足，受到惊吓，烟酒刺激，吸入有害气体，或者上呼吸道存在一些慢性病灶等情况，都会导致机体防御能力的降低，引起扁桃体化脓。第二，细菌和病毒的感染，目前主要由细菌感染导致，以溶血性链球菌为主，还有葡萄球菌，肺炎链球菌等，近年来也发现还有厌氧菌，细菌和病毒的混合感染，这些也会导致扁桃体化脓。
平时需要注意锻炼身体，提供身体的防御能力，保持心境平和，不要易怒易躁，保证休息和睡眠时间；注意家居清洁，多通风，勤消毒。