扁桃体化脓主要是看扁桃体局部的红肿的程度、脓液的多少以及咽痛的症状来确定治疗方式，比如口服药物治疗、输液治疗、局部切开排脓治疗。
如果症状比较轻微，局部化脓，脓液脓点比较少，扁桃体红肿不是很厉害，对抗生素不过敏的情况下可以先口服一些抗生素，并常用漱口水漱口。如果咽痛比较明显，甚至有吞咽困难，扁桃体局部脓点比较多，红肿非常严重，甚至伴有全身发热、畏寒等症状可以输液治疗，主要还是用药以抗生素为主。扁桃体化脓如果不及时治疗，有时可以在局部形成脓肿，形成扁桃体周围脓肿，可能除了抗炎治疗以外，有的可能还需要局部切开排脓。
在治疗时建议注意饮食清淡，避免辛辣，避免引起化脓性扁桃体炎复发。