肉芽肿的治疗一般以手术治疗为主，也可以进行激光治疗。
当肉芽肿数量比较多，比较表浅时可以采用激光方法治疗，不会留有疤痕。但是由于基底部没有彻底清除，容易复发，所以对于体积比较大的深部肉芽肿，应该以手术切除肿块。术后每天换药，服用抗生素药物治疗。对于化脓性肉芽肿，先将脓液引流后进行手术治疗。
肉芽肿可以进行外用药、激光、冷冻、手术切除等方式，平时要注意卫生，勤洗澡，穿棉质的衣物，还要注意饮食，多食富含维生素的新鲜蔬菜和水果，不要吃辛辣刺激性的食物。