肠道菌群失调首先要查明原因。
在临床上最常见的是长期应用抗生素以后出现肠道菌群失调，最主要的治疗首先要停止诱因，把抗生素停掉。除此之外，患者在饮食上要注意多喝酸奶，尤其是常温的酸奶这一类可以调节肠道菌群的食物。
建议：病菌杀掉后，要重建肠道菌群，一般选用有益菌进行补充；另外还要用胃黏膜保护药物和止泻药物进行辅助治疗。