婴幼儿腹泻的病因较为复杂，除了个别情况属于“生理性腹泻”不需治疗外，绝大多数都是病理性的，这其中少数是由于气候变化、饮食改变、腹部受凉、肠道过敏等引起的非感染性腹泻，其余均为感染性腹泻。炎热季节（3—9月）细菌性肠炎约占70％，寒冷季节（10月—次年2月）病毒性肠炎约占50—80％。