口腔溃疡优先选择局部用药治疗。
止痛药物的代表药物有利多卡因凝胶、喷剂、复方苯佐卡因凝胶、苄达明喷雾剂等，将其涂于溃疡面，仅限在疼痛难忍时使用，以防成瘾。也可以根据中药理论四诊八纲进行辨证治疗。
此外，激光照射可帮助黏膜再生，降低炎症反应，促进溃疡的愈合。