乙脑炎患者可能会出现剧烈的头痛、发热、颈项强直等症状。
疾病初热期，体温在1~2日内升高到38~39℃，伴头痛、神情倦怠和嗜睡、恶心、呕吐。小儿可有呼吸道症状或腹泻。极其突出表现为全身毒血症状及脑部损害症状。恢复期个别重症者表现为低热、多汗、失语、瘫痪等，患者注意积极治疗。