脑膜脑炎的后遗症有肢体运动受到影响，还容易引起脑神经受损，影响治疗，可能会表现为智力障碍、失语、失明、眼球麻痹、癫痫、运动障碍、吞咽困难等后遗症。
患有脑膜脑炎后，患者可以通过医生合理服用营养神经的药物，同时建议做针灸按摩，可以预防后遗症的发生。