肠结核大多数是由于自身本身存在肺结核，吞咽了含有结核分枝杆菌的痰液导致感染。有一般治疗和抗结核化学药物治疗。
同时建议患者要卧床休息，改善营养加强抵抗力是治疗的基础，治疗原则为早期，联合，适量，规律，全程。此外，平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，少熬夜。