电子肠镜一般是只有疼痛，但是一般没有什么危险和副作用的，如果你做无痛肠镜，要打麻醉的话，可能会出现麻醉意外，出血，过敏等等可能，但是可能性很小。如果你要做，可以再检查前3天，停服铁剂药品，开始进食半流质或低渣饮食，如鱼、蛋、牛奶、豆制品、粥、面条、面包、香蕉、冬瓜、马铃薯等。

无痛肠镜与普通肠镜检查一样，都会存在一定的风险。
无痛肠镜可能对黏膜造成损伤导致出血，还有在肠镜检查过程中可能会出现穿孔，尤其是在麻醉的状态下，可能病人配合会更好，但是出现明显的疼也没有反应，从而穿孔的风险相对比普通的肠镜检查要高，建议积极配合医生。