小儿腹胀主要是由于肠胃蠕动障碍，分为单纯功能性的称为“假性肠阻塞”，和肠胃道真正缺乏神经节的“先天性巨肠症”。
肠胃蠕动障碍的严重程度不同，可从慢性便秘和腹胀到严重呕吐，可以是暂时或终身的。
此外，小儿腹胀有可以是吞食过多的空气造成的，小儿过多哭闹也容易导致腹胀。