治疗原则：早期诊断,早期治疗，终身服药，甲状腺素从小剂量开始，定期随访。新生儿一旦发现甲状腺功能低下应立即接受T4治疗,以尽快恢复正常的甲状腺功能。治疗的时间和是否接受足够的治疗与神经系统后遗症相关。暂时性甲低者，一般需正规治疗1～2年后，停药1.5个月，再复查甲功,如正常，可停药。。（1）治疗期间避免食用大豆、纤维素和含铁丰富的食物,这些成分均能够影响T4的生物利用度。（2）1周后复查FT4,以保证合适的血清T4升高速度。（3）治疗2周内T4应该至少升高至100μg·L-1,FT4升高至26pmol·L-1。TSH应该在1个月内恢复正常。（4）LT4的剂量应根据血清FT4、TSH水平和临床表现调整。（5）在治疗的前3d,血清总T4和FT4应在正常参考范围的较高水平（50%以上）,血清TSH应控制在0.5～2.0mU·L-1。（6）神经垂体素（垂体后叶素）的抵抗作用可能延迟血清TSH的恢复,而导致患儿血清T4水平正常或增高,而TSH却增高。对于这类患儿,用药剂量应根据血清T4水平来调整。治疗中应监测药物过量：短期可有甲亢症状，长期（3~6月）过量可致骨质松，颅缝早闭甚至骨龄超前。为保证生长发育需要，应供给充分热卡及营养、VitD、钙剂等。