1、牙痛：三叉神经痛常误诊为牙痛，往往将健康牙齿拔除，甚至拔除全部牙齿仍无效，故应注意。牙病引起的疼痛为持续性疼痛，多局限于齿龈部，局部有牙痛及致病病变，X线及牙科检查可以确诊。 2、副鼻窦炎：如额窦炎、上颌窦炎等，为局限性持续性痛，可有发热、鼻塞、浓涕及局部压痛等。 3、青光眼：与三叉神经痛相似的疾病，单侧青光眼急性发作误诊为三叉神经第1支痛，青光眼为持续性痛，不放射，可有呕吐，伴有球结合膜充血、前房变浅及眼压增高等。
与三叉神经痛相似的疾病，三叉神经痛疾病需要及时的发现和及早的治疗，但是很多三叉神经痛患者发现的时候已经非常的晚了，对疾病的治疗带来了很大的困难，这种情况主要是因为三叉神经痛疾病和很多疾病有相似点，容易混淆导致的