问题分析：你好，你所说的情况小便后有点疼痛已经有一个多月，检查的是支原体包涵体阳性 一般来说确实要考虑属于非淋菌性尿道炎的情况，特别是如果之前有不洁性生活的话。
意见建议：一般来说具体的用药是需要进一步分泌物细菌培养和药敏试验确定有效的抗生素足量足疗程治疗比较好的。同时三金片.蒲地蓝消炎片等药物一块治疗，同时注意多补充水分帮助细菌从尿路排除，期间避免吃生冷辛辣刺激容易上火的食物。祝你早日康复。