结膜炎的治疗，若是急性病毒性结膜炎，可点用类固醇(可地松)眼药水，以减轻病情。细菌性结膜炎，则须投与抗生素药水、药膏，甚至口服或注射抗生素。
若长期使用眼药水或眼药膏所引起的，可先停用眼药一段时间，点用不含药物及防腐剂之眼药水(如生理食盐水或人工泪液)；而以毛巾热敷眼部(闭眼睛)一天三至四次，每次五至十分钟，也是简单易行而有效之方法。
此外须特别提醒的是，结膜炎虽不是什么大毛病，但结膜炎并不是“眼部充血”的唯一原因。眼部充血除了结膜炎外，也要考虑是眼部其它疾病，如角膜破皮、虹彩炎、青光眼、角膜溃疡或是眼睛内部发炎等眼疾之警讯，不可以大意