凝结芽孢杆菌活菌片和头孢克肟两种药品要分开服用，头孢克肟是抗生素，会削弱芽孢杆菌的疗效。
凝结芽孢杆菌活菌片，治疗因肠道菌群失调引起的急，慢性腹泻，慢性便秘，腹胀和消化不良等症。头孢克肟（Cefixime）为口服用的第三代头孢菌素类抗生素，适用于治疗敏感菌所致的呼吸，泌尿和胆道等部位的感染。头孢克肟对革兰阴性杆菌产生的β-内酰胺酶高度稳定，对革兰阴性杆菌抗菌作用强于第一代和第二代头孢菌素，对革兰阳性球菌抗菌作用不如第一代和第二代头孢菌素。