引起男性尿道感染的主要原因有以下几个方面：
1、尿路梗阻：发生尿路梗阻后，就会排尿不畅，从而使膀胱内的细菌不易被排出，造成细菌在膀胱内大量繁殖。再则，尿路梗阻部位以上的尿路组织，由于所受到的压力增加，影响了其局部的血液循环，降低了尿路局部粘膜的抗感染能力，故易发生尿道感染。
2、用器械在膀胱内做过检查：如做膀胱镜检查、导尿、或留置尿管时，一些不正规医疗场所的医生操作失误，可造成上尿道感染。
3、尿路先天畸形或排尿功能缺陷：如肾脏发育不全、有多囊肾、输尿管畸形或膀胱输尿管反流(即排尿时，尿液从膀胱逆流至肾盂的反常现象)等病症的人，易患尿道感染。