患临床甲减的孕妇更易罹患流产、胎盘早剥、产后出血等产科合并症。未经治疗的妊娠甲减可导致胎儿早产、低出生体重的发生率上升，胚胎死亡风险也会增加。除此以外，因为甲状腺激素对于胎儿的大脑发育至关重要，妊娠早期的甲减可导致婴儿10月龄时发育指数偏低。若甲减持续到妊娠24周以后，可使后代的行为认知能力评分降低8-10分。