（1）肺型：包括持续性干咳，既而呼吸困难、胸痛以及胸部X线检查肺部有弥漫性浸润。动脉血气分析，常伴有轻度低氧血症，组织病理检查有大量肺襄虫，支气管灌洗液或气管内膜活检中均可找到病原虫。在停止治疗后复发率高。此外军团菌、隐球菌、弓形体、类圆线虫、巨细胞病毒以及a-疱疹病毒I型或Ⅱ型均可引起肺炎。大多数艾病滋病人死于本病。
（2）中枢神经系统型：HIV具有嗜神经性，可侵犯神经系统，能感染脑、脊髓和周围神经细胞。中枢神经系统中的单核细胞和巨噬细胞是HIV的重要贮存细胞，可产生病毒，并不断侵犯其他的T淋巴细胞。使得中枢神经系统的症状与各种条件性感染引起的症状并存。较常见的神经障碍是亚急性脑炎（艾滋病脑病或痴呆综合症），临床上常表现为疲乏无力、记忆力丧失、表情淡漠、共济失调、性欲减退等。疾病后期可发展为痴呆、意识不清、大小便失禁、部分瘫痪（偏瘫或截瘫）、有些病人甚至出现癫痫样发作。这些症状和体征可单独出现，也可与艾滋病的其它症状同时出现。
　　脑CT检查，无局灶性病变，但有双侧脑室扩大，脑活检或尸解为非特异性炎症，常伴有脱髓鞘变，但找不到致病原。WHO提供的资料强调，HIV对神经系统的损害是HIV感染极其重要的一方面，可以形成急性，亚急性及慢性及慢性过程，对健康影响极大。
（3）胃肠型：主要表现为大量水样腹泻，每日15升，进行性体重下降20-40，严重者可出现营良等恶液质。治疗无效，导致脱水死亡。大便浮聚和肠粘膜活检可见溶组织阿米巴，隐孢子虫、贾弟鞭毛虫、菌痢和空肠弯曲杆菌。
（4）发热原因不明型：因病原体感染，常出现持续性的体温升高（38-40℃），可延续几周以上，并出现盗汗。在有病例的骨髓，淋巴结或肝活检标本中证实有乌技杆菌细胞内感染。
艾滋病患者多数易患有各种皮肤粘膜感染；最常见的是口腔粘膜念珠菌病，表现为舌和颊粘膜上的白斑，常在红色基底上出现，这种感染无症状，也可播散到口咽或食道，引起严重的吞咽困难，常见的是口腔粘膜感染是复发性单纯疱诊性口炎，病变常复发，长期持续，常见累及唇和咽。有文献报道，艾滋病的最初表现中有严重的慢性溃疡性肛门周围单纯疱疹病损，这种溃疡可能相当大，在病变的陡壁上可找到多核巨细胞或病毒，带状疱疹水痘皮疹在艾滋病患者中的发生率也增高，带状疱疹常撒播到几个皮神经区；疣是另一种常见的皮肤病毒感染，同性恋者患艾滋病可发生大的肛门周围尖湿疣，此种病较顽固，治疗较困难，皮肤真菌感染是艾滋病人一种常见的问题，腹股沟和肛周的念珠菌感染有时很严重，由念珠菌或毛癣菌引起的甲癣也常见；某些非感染性皮肤病在艾滋病患者中也常见，有药瘾的艾滋病患者，可出现多发性瘢痕和反复注射引起的溃疡，也可见到紫癜。此外脂溢性皮炎在艾滋病病人中的发生也多见，在病人的头皮、面、耳、胸以及更多见于生殖器，表现为红斑样、角化过度的鳞屑斑。在面部通常呈蝶形分布，其病因至今还不明。同时还伴有恶性肿瘤的发生，如：卡波西氏肉瘤亚性淋巴瘤、皮肤鳞状细胞癌，基底细胞癌、色素瘤等。