在通常情况下，脚气的症状消除后，真菌仍然会存活在皮肤鳞屑或鞋袜中，当遇到潮湿温暖的环境，真菌又会大量繁殖，导致脚气复发。
还有一部分人不注意养成爱清洁讲卫生的好习惯，就算脚气已被治愈，一旦长时间穿不透气的鞋袜，使用他人的脚盆、拖鞋、毛巾，或在公共浴室、游泳池和地毯上赤脚行走等，也很容易再次感染而导致脚气复发。因此，反复发作成为脚气的一大特色。
脚气是由真菌感染引起的，症状较轻的脚气可以外用抗真菌药如兰美抒、美克或派瑞松软膏等。但如果是慢性脚气，皮肤肥厚角化，用一般外用药达不到彻底治愈的目的。为了彻底根治脚气，可以内服兰美抒或斯皮仁诺(伊曲康唑)，但这两种药物在使用前一定要把握好适应症和禁忌症，故必须在专科医生的指导下用药。
　　此外，脚气有不同的类型，在治疗上也不尽相同。要根据脚气的不同类型，分析病情进行治疗。
　　水疱型脚气，要选择既有抗过敏作用，又有抗真菌作用的药物，如派瑞松、益肤清、酮康王等，剂型要选择霜剂，要避免用酒精制剂(如脚气水、韦氏洗剂等)，避免因此而引起过敏反应。如果有大量水疱，且出现浸渍、糜烂，可以用复方硫酸铜液1:20泡足，也可用马齿苋60克，煎水，泡脚。
　　角化过度型，可用脚癣药膏或1～3克霉唑霜等。
　　如果是趾间感染，应先用脚气粉等，待皮损收干脱皮后，再用克霉唑霜或槿皮酊等药。也可以用派瑞松、益肤清、兰美抒(丁克)、美克等膏剂涂搽。
　　如果合并有过敏现象(如瘙痒、出现密集小疙瘩及小水疱等)，就要避免用刺激性的药物，如脚气药水(如水杨酸酊)。
　　如果出现发烧，局部皮肤红肿，考虑有丹毒，或有淋巴管炎时，就需要找医生，采用抗生素治疗，如内服红霉素、阿莫西林或注射青霉素等治疗。
　　如果遇到反复发作的脚气，或出现癣菌过敏、癣菌疹，或者慢性角度增厚型脚气，或合并甲癣(灰指甲)，应在医生的指导下，口服抗真菌药(如兰美抒、斯皮仁诺等)。
　　足癣虽说不上是什么大病，现在已有很多药物能将其治好，但令人烦恼的是此病极易复发或再感染，所以治疗要彻底，不要见皮损稍有好转就停药。即使已经治愈，也应注意远离传染源，不要再被感染上。
如果只是外用药物，关系不大。