斑秃痊愈后常可复发。有的患者几个月后复发，也有几年后又复发。有的病人只复发1次，有的复发多次。斑秃的复发没有规律，一般来说有斑秃家族史者，尤其是有斑秃复发家族史者出现复发的机会要大的多。少数患者斑秃多次复发后，可发展成全秃后普秃。
少数斑秃患者可出现指甲的改变，表现为甲板上多数粟粒大小的凹陷甲板表面粗糙不平以及脆甲、脱甲等。伴有指甲改变者是斑秃严重的标志。大部分轻症和一般性斑秃部出现指甲异常，伴有甲板病变者，斑秃的自愈可能性较小。
斑秃的病程很不一致，斑秃会发展到什麽程度，是否会出现新的损害，是否会有复发等很难做出准确的预测。一般情况下，多发性斑秃比单发性者重些，全秃比斑秃更重，最重者为普秃。多数斑秃经数月或更长时间后可以自愈，也有很少数斑秃包括全秃和普秃，虽经各种方法治疗也难以治好。