问题分析：你好！你两月前得过肾盂肾炎，不知你是否在正规医院肾内科系统治疗过，如果经两个疗程的足量抗菌治疗后，尿菌仍持续阳性，需要继续药物治疗并且定期复查，否则会转为慢性肾盂肾炎。大腿及腰部疼痛，我个人考虑跟这个病没有必要联系。
意见建议：中医讲“不通则痛”，可以考虑理疗的办法。我个人考虑有神经性疼痛因素存在，可以适当服用些营养神经的药物。