问题分析：对于三个月的小婴儿，由于气管没有发育成熟，如果有咳嗽症状多考虑支气管炎的可能，目前宝宝伴有流鼻涕症状，病毒感染的可能性大，一般病程是一周左右。
意见建议：建议口服利巴韦林颗粒抗病毒药治疗，加服易坦静化痰止咳对症处理，对于宝宝绿色大便一般属于正常大便，可以暂时不用处理，注意观察就行。如果咳嗽症状未有缓解，需要及时去医院就诊，明确病情，调整治疗方案。