病情分析： 真菌性角膜炎是非常难治的，这个是眼科临床上面非常棘手的。你已经做了角膜瓣遮盖术，如果穿孔那说明角膜溃疡没有控制住，要继续治疗真菌感染。控制不了再做手术也是没有效果的。
意见建议：根据你的描述，你的药物还是蛮齐全的，在外用药上面不需要再加其它药物了，你除了经常用这些滴眼液以外，还可以口服伊曲康唑胶囊，按照说明书服用，我治愈过类似病例。