1、染色体异常染色体数目和结构异常，尤其是性染色体异常，会严重影响睾丸生精功能，造成精子减少甚至无精子。精子密度低于1000万/毫升的患者，都应做染色体检查。另外，Y染色体上与生精有关的基因-无精子因子有微缺失时，也会导致患者出现严重少精子甚至无精子。2、隐睾症由于睾丸没有下降到阴囊，长期导致睾丸温度升高，引起睾丸发育不全或萎缩，导致生精障碍，使精子生成减少。隐睾症最好在两周岁前进行治疗，否则治疗意义不大。