去除结石的方法需要根据结石的部位、数目、大小、肾功能、是否合并解剖异常、是否合并感染、以及身体状态等情况来制定首选体外碎石。2cm以上的肾结石首选经皮肾镜取石。国内首先开始进行体外碎石和包括经皮肾镜取石等各种肾结石的微创治疗，已经有近30年的经验。开放手术取石的应用已经越来越少了，在合并泌尿系统解剖异常时，可以开放手术治疗解剖异常同时取石。