肛瘘不能自愈，必须采取手术方法切除病灶或敞开肛瘘，暴露创面使其愈合，这是肛瘘的处理原则。手术前确定内口的位置和瘘管与肛门括约肌的关系，是手术的关键。手术时完全切除，防止复法，避免因括约肌损伤而引起肛门失禁，是肛瘘手术的要点。