问题分析：您好，巧克力囊肿的话，那么这个囊肿是不会自己消失的，所以在妊娠前期容易出现卵巢囊肿扭转的情况，这个是要急诊手术处理的，除了这个一般的没有太大的影响。
如果子宫情况还好，卵巢功能还好，自已无法怀孕，可以考虑做试管婴儿，一则随着内膜异位病程延长，多少对子宫有影响，更不利于怀孕，如果经济实力允许，是可以的。希望能帮助您，祝您健康