病情分析： 上述上情况，首先需要先核实一下情况，就是连续咳嗽很长时间，经气管镜检查，诊断了肺结核，伴有真菌感染。如果是这样的情况，目前的原因已经很明确了，第一有结核菌感染是可以导致咳嗽的；第二，同时感染真菌，也是可以导致咳嗽的，
意见建议：而且这两者是有可能同时存在的，一般来说肺结核的患者体质相对是比较差的，容易感染结核菌，其次真菌感染也是常见于体质较差，自身的内环境紊乱的患者，这种情况还是需要及时治疗的。