全身疼痛常见于许多急性传染病和寄生虫病的前驱期和发热期以及慢性期。某些细菌性疾病感染后期作为并发症而出现全身疼痛如：细菌性痢疾后关节病、沙门菌后关节炎等。
有许多细菌、病毒、寄生虫感染后所致的疾病，除了具有其独特的临床症状及体征，而全身疼痛的症状可能存在，甚至比较明显，对于这些疾病的诊断要全面检查、综合分析、最后得出诊断