慢性非细菌性前列腺炎的治疗目的因不同病变时期而侧重有所不同。在疾病初期在于消除不良致病因素的持续刺激，缓解前列腺的充血，改善前列腺液堆积、淤滞的病理特征；病变中期，应将重点放在减缓前列腺组织的纤维化变；后期则应改善或减缓前列腺组织的皱缩，促使其分泌功能的正常发挥。
　
　由于慢性非细菌性前列腺炎的病因不明，因此，在治疗上总体应以中医为主。只有在病原确定为支原体、衣原体、病毒时才采用相应的西医的对症治疗。一旦病原得以清除，而症状与体征未能完全消除者应仍转以中医治疗为主