慢性肠炎泛指肠道的慢性炎症性疾病，其病因可为细菌、霉菌、病毒、原虫等微生物感染，亦可为过敏、变态反应等原因所致。临床表现为长期慢性、或反复发作的腹痛、腹泻及消化不良等症，重者可有粘液便或水样便。
非药物治疗
　　（1）适当休息，进食易消化的食物，禁食油煎和刺激性食物。　　（2）酌用止泻剂，可给次碳酸铋，复方樟脑酊，每日3次。　　（3）解痉剂，可用阿托品，每日3次；普鲁苯辛，每日3次。　　（4）按细菌培养和药敏试验选择抗生素，但病情要长。也可用黄连素液或大蒜浸液，保留灌肠，每日一次，10～20天为一疗程。其他治疗同急性肠炎。　　（5）精神性腹泻者，可用苯巴比妥。
药物治疗
　　（1）消炎止痛：细菌感染，除选用致菌培养有效抗生素外，可选用黄连素，元胡止痛片，胃肠灵，每日3次。病情出现发热、脱水、休克可适当选用抗生素，必要时输液输血或吸氧。　　（2）溃疡性结肠炎、腹泻、便秘反复发作人群可口服金双歧，金双歧所含肠道益生菌活力组合通过修复肠道生物屏障、调节肠道免疫功能、抑制肠内致病菌生长，促进肠道生理功能恢复正常，有效减轻腹痛、腹胀、腹鸣、大便不成形等慢性肠炎症状。　　（3）解痉止痛：阿托品，肌肉注射；或普鲁苯辛