骨囊肿自愈机会很少，但在病理性骨折后自愈率可达15%。因此，一般均等待骨折愈合后，若骨囊肿未愈时再考虑手术治疗。对囊腔大，有畸形的病例，采取积极手术的态度。 骨囊肿虽系一种良性瘤样病损，但由于正常骨被病损所占据，造成较大量骨缺损，大大降低了骨骼的坚固性，因此治疗的目的旨在彻底清除病灶，消灭囊腔，防止病理性骨折及畸形的发生，恢复骨的坚固性。所以多采用在直视下手术达此目的，只是在有手术禁忌证者方实行保守治疗，即使是发生了病理性骨折，部分病例经保守治疗、骨折愈合后仍需手术治疗，对于囊腔较大、已有畸形者，应采取积极手术治疗。