囊虫病的治疗：常用的药物有：吡喹酮：系一种广谱的抗蠕虫药物,对囊虫亦有良好的治疗作用.常用的剂量为120mg/kg,分6天（每天三次）口服.服药物囊虫可出现肿胀,变性及坏死,导致囊虫周围脑组织的炎症反应及过敏反应,有的患者还可出现程度不等的脑水肿,脑脊液压力与细胞数增高,严重者甚至发生颅内压增高危象.
丙硫咪唑,亦系广谱抗蠕虫药物.常用剂量为每日15-20mg/kg,连服10天.常见的毒副反应有皮肤瘙痒,荨麻疹,头昏,发热,癫痫发作和颅内压增高.