森林脑炎治疗以对症处理为主，高热、抽痉、昏迷、呼吸衰竭等症状处理与乙型脑炎相同，重危病人可使用恢复期病人或已患过本病的人血清。后遗症以瘫痪为主，应采用针灸、推拿、体疗等综合治疗。 重危患者早期可试用恢复期血清或林区人员血浆，肌注20～40ml/d，2～3d。有条件时可肌注或静注高效价免疫球蛋白6～9ml/d，亦可试用α干扰素等。
具体方案

　　（一）一般治疗及对症治疗护理、降温、止惊以及呼吸衰竭等处理可参照乙脑的治疗。
　　（二）免疫疗法
　　1．血清疗法 起病3天内患者可用恢复期患者或林区居住多年者的血清20～40ml肌注，或椎管内注射5～10ml。
　　2．高效价免疫丙种球蛋白每日6～9ml肌注，至体温降至38℃以下停用。
　　3．干扰素、转移因子、免疫核糖核酸，核糖核酸酶均可酌情采用。