1.全身口服药物
(1)甲硝唑：首选，成人0.4～0.6g/次，3次/d，儿童50mg/(kg?d)，分3次，10天1个疗程。
(2)氯喹：0.5/次，2次/d，2天后改为0.5g/d，共2～3周。
(3)喹碘方：成人1.5～3g/d，儿童42mg/kg，分3次口服，10天1个疗程。
(4)抗生素：并发细菌感染时可选用相应的抗生素。
2.局部处理
(1)每天清洗患处，然后外敷甲硝唑软膏，如合并细菌感染可选用有效的外用消毒液湿敷。
(2)根据皮肤损害情况，进行手术清创术、切除术、植皮术或电灼、微波、激光等理疗。
3.去除感染源 治疗阿米巴病的原发灶(如阿米巴痢疾)，亦以口服甲硝唑为主;注意饮食卫生、内衣裤煮沸消毒;配偶或性伴、同居家人作相应的检查和必要的治疗。
4.中草药大蒜、鸭胆子等中药也是很好的抗阿米巴药物。