男生殖系结核的治疗必须包括全身治疗和男生殖系的治疗。全身治疗与一般的结核病治疗相同。男生殖系治疗包括药物治疗和手术治疗两部分： 　　（一）药物治疗 男生殖系结核用抗结核药治疗有较好的效果。前列腺及精囊结核均可用药物保守治疗。药物治疗的方法与肾结核相同，采用以异烟肼、链霉素、利福平等为主的两种或三种药联合应用。应用的疗程一般经验为6～12个月。 　　（二）手术治疗 男生殖系结核的手术治疗主要解决生殖系的附睾结核。附睾结核的解决有助于生殖系其他部位结核（精囊、前列腺）的愈合。手术在附睾病变局限后施行与肾结核相同，在手术前后亦需要给抗结核药物。