迁延与慢性腹泻患儿宜到医院治疗。
1.液体疗法 积极做好液体疗法,预防脱水、纠正水、电解质、酸碱平衡紊乱。
2.营养治疗 此类病人多有营养障碍，因此继续饮食是必要的治疗措施，禁食是有害的。
(1)继续母乳喂养。
(2)人工喂养者应调整饮食，6个月以下小婴儿，用牛奶加等量米汤或水稀释，喂2天后逐渐恢复正常饮食，或用酸奶，也可用奶-谷类混合物，每天喂6次，以保证足够的热量。6个月以上的幼儿可用已习惯的日常饮食，选用稠粥、面条，并加些熟植物油、蔬菜、肉末或鱼肉等，但需由少到多。
(3)静脉营养：少数严重病例口服营养物质不能耐受，应加支持疗法。有条件可采用静脉营养。方案：10%脂肪乳每天2～3g/kg，复方结晶氨基酸每天2～2.5g/kg，葡萄糖每天12～15g/kg，电解质及多种维生素适量，液体每天12～15ml/kg,热卡每天209～376kJ/kg(50～90kcal/kg)，通过外周静脉输入。总液量在24h内均匀输入(最好用电脑输液泵控制速度)，好转后改用口服。
3.药物疗法 抗菌药物应慎用，仅用于分离出有特异病原的患儿，并要依据药物敏感试验结果选用。补充微量元素与维生素锌、维生素A、C、B、B12和叶酸，同时给予微生态疗法。
(1)肠黏膜保护剂：为双八面体蒙脱石粉。适用于急性水样便腹泻(病毒性或产毒素细菌性)及迁延性腹泻。该药能吸附病原，固定毒素，然后随大便排出体外，并能加强胃肠黏膜屏障功能，促进肠黏膜的修复。
常用有双八面体蒙脱石(思密达)，疗效较好。现今已有国产双八面体蒙脱石粉，也可试用。每袋0.3g，剂量：3岁，每次1袋，3次/d。
(2)微生态制剂：目的在于补充肠道正常菌群，恢复微生态平衡，重建肠道天然生物屏障保护作用。