1.非手术治疗(1)全身治疗：全身治疗尤其适宜同时患有肺结核或其他部位结核的患者。适当给予高蛋白高热量高维生素的饮食及药物，以改善患者全身状况。(2)药物治疗健康搜索：甲状腺结核一经确诊即可先给予抗结核药物治疗由于无法确信是否存在其他脏器的结核病灶，无论何种类型的甲状腺结核均应进行全身抗结核治疗。关于治疗方案，目前仍提倡联合用药，即每天用异烟肼0.3g，利福平0.45g及乙胺丁醇0.75g和吡嗪酰胺250mg，顿服即可。维持 2个月后继续用异烟肼、利福平和乙胺丁醇7～10个月。疗程较常规抗结核治疗要长，根据病情需要可延长至1年。治疗期间要定期检查肝功能，并适当给予高蛋白高热量、高维生素的药物和饮食，以改善全身状况。2.手术治疗 手术治疗主要用于干酪型和增生型甲状腺结核，应在积极抗结核治疗及全身状况改善的前提下，酌情采用不同的手术方法。(1)对干酪坏死形成寒性脓肿，脓肿较小者可穿刺抽除脓液，然后在脓腔中注入链霉素；脓肿较大时，可行病灶清除或切开引流。(2)对增生型甲状腺结核，可行一侧甲状腺叶全切除或次全切除，并同时切除峡部，以防出现气管压迫。在术中不能除外甲状腺癌时应行结节健康搜索的冰冻切片检查，然后调整手术方案，决定手术的切除范围健康搜索。(3)对有窦道形成，粘连?不重周围有结核改变而无手术禁忌证者，可行一侧病灶的大块切除。(4)如有甲状腺结核的周围器官受累时，如喉、纵隔或颈部大血管受累时，不宜手术治疗。术毕后，应反复冲洗切口并置入链霉素，常规放置引流。切口大多可以一期愈合，较少形成瘘管或窦道，术后继续抗结核治疗半年以上。