IV/AIDS肺部各种病原体感染治疗参见各相关章节，其抗微生物治疗与一般患者基本相同，但应注意HIV/AIDS者抗感染化学治疗时毒副反应发生率较高且严重，应密切观察和防范。抗HIV治疗需参照CD4+和病毒含量。若CD4+＜500/μl和病毒含量每毫升＞500拷贝者有治疗指征；CD4+＞500/μl和病毒含量＞500拷贝者是否治疗尚无统一意见，若病人合作则可以治疗；CD4+＜200/μl而病毒含量低于可检测水平者，不治疗，定期复查。最常用治疗方案是两种核苷酸反转录酶抑制剂(NRTIs)和一种蛋白酶抑制剂(PI)。并发各种严重的细菌、真菌和(或)病毒性感染。