尖锐湿疣主要是以外治为主，内治为辅。外治的方法很多，有药物治疗、冷冻治疗、激光治疗、微波治疗、电烧治疗、手术治疗等。药物治疗方便，易于操作，但一般需要重复数次，而且有些药物，如三氯醋酸，有灼伤粘膜的可能。
一、药物治疗。对于较小较少的损害。
(1)5％5-Fu软膏 5-Fu是一种常用的抗肿瘤药物，它能抑制细胞的增殖，力量较为温和，一般需治疗2～3周。
(2)疣敌：用单孔或多孔的塑料小棒，将0.5％“疣敌”溶液滴于湿疣上，并使药液慢慢渗透到疣基底，点药后的湿疣紫色，待自干后即可，注意点药不可过多，以避免药液流到正常组织。点药4小时后用清水洗去。