巨细胞病毒所引起的先天性感染在所有先天性感染中是最常见的，巨细胞病毒在病毒家族中是比较大的一种，所以才称为巨细胞，但仍然可以通过胎盘传染给胎儿。巨细胞病毒引起的先天性感染，通常是全身性的，因此会影响到许多器官，出生后的典型症状包括子宫内生长迟滞、小头、肝脾肿大、病理性黄疸、皮疹或出血点、肺炎、听力及视力受损，智力或运动障碍，这些症状可单独出现或合并出现。 目前已有抗病毒药物可以用来治疗巨细胞病毒感染，但因为抗病毒药物的毒性甚强，尤其是新生儿是否要治疗，仍需由医师依据临床症状判断，因为有些感染只需保守治疗也可逐渐痊愈。因为巨细胞病毒可以经由排泄物或分泌物进行传递，因此一旦发现有先天性巨细胞病毒感染的新生儿或婴幼儿，应该加以隔离，以免传染给其它的婴儿。