治疗UTI的目的是以最小的花费，最少肾毒性及副作用，最少耐药菌群的产生，达到预防或治疗全身脓毒血症，缓解症状，清除隐匿性感染灶，清除肠道和阴道中的尿道致病菌，防止远期并发症。对不同类型的尿路感染需采取不同的治疗措施以达到上述目的的最佳效果。