附睾结核应与慢性附睾炎相鉴别。慢性附睾炎疼痛较明显，增大的附睾不如结核硬大，很少形成局限性硬结，不形成窦道，无输精管串珠改变。丝虫病所形成的硬结则位于附睾及输精管周围，可资鉴别。
治疗原则与肾结核相同，早期可采用药物治疗，若治疗效果不明显或病变扩大，有脓肿形成，则可行附睾切除，手术前后应进行抗结核治疗，术时应尽量保留睾丸，若睾丸有病变，病变靠近附睾，则可连同附睾将睾丸部分切除。